Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBL1P28749 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms