Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCAP28676 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCAP28676 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms