Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms