Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms