Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNOP22674 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms