Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT1P21579 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms