Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXB1P14653 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms