Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms