Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms