Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms