Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODC1P11926 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODC1P11926 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODC1P11926 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms