Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTHFD1P11586 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms