Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHGAP10645 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms