Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms