Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms