Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM200BP0CF97 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM200BP0CF97 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms