Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms