Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PF4P02776 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PF4P02776 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PF4P02776 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PF4P02776 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PF4P02776 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PF4P02776 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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