Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC1P02654 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms