Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRMUO75648 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRMUO75648 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRMUO75648 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRMUO75648 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRMUO75648 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRMUO75648 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms