Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms