Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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