Protein–RNA interactions for Protein: O15258

RER1, Protein RER1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RER1O15258 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RER1O15258 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RER1O15258 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RER1O15258 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms