Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms