Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP290O15078 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP290O15078 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP290O15078 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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