Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1AO15047 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1AO15047 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms