Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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