Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS8O00217 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms