Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DXG7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DXG7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms