Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms