Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A4D1N5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A4D1N5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A4D1N5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms