Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms