Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISPDA4D126 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms