Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms