Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP15Q9Y4E8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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