Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms