Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms