Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms