Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD4Q9ULV1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms