Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms