Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM8A1Q9UBU6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms