Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms