Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms