Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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