Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms