Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1BQ9NZR2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms