Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GDE1Q9NZC3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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