Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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