Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms