Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMILIN3Q9NT22 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms